MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015942	CGG	2	6	76543	76548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1502	NC_015942	TGA	2	6	76640	76645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
1503	NC_015942	GGCG	2	8	76668	76675	0 %	0 %	75 %	25 %	344198306
1504	NC_015942	CGC	2	6	76709	76714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1505	NC_015942	TGC	2	6	76761	76766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1506	NC_015942	CG	3	6	76779	76784	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
1507	NC_015942	AG	3	6	76836	76841	50 %	0 %	50 %	0 %	344198306
1508	NC_015942	TTC	2	6	76857	76862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1509	NC_015942	GCC	2	6	76873	76878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1510	NC_015942	GC	3	6	76890	76895	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
1511	NC_015942	ATA	2	6	76920	76925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198306
1512	NC_015942	CCG	2	6	76952	76957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1513	NC_015942	ACC	2	6	76962	76967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1514	NC_015942	CAC	2	6	76974	76979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1515	NC_015942	GACTG	2	10	77009	77018	20 %	20 %	40 %	20 %	344198306
1516	NC_015942	GCCC	2	8	77022	77029	0 %	0 %	25 %	75 %	344198306
1517	NC_015942	CTGGC	2	10	77059	77068	0 %	20 %	40 %	40 %	344198306
1518	NC_015942	CG	3	6	77075	77080	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
1519	NC_015942	CAC	2	6	77100	77105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1520	NC_015942	CCG	2	6	77197	77202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1521	NC_015942	ACGG	2	8	77268	77275	25 %	0 %	50 %	25 %	344198306
1522	NC_015942	CCG	2	6	77296	77301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1523	NC_015942	CAG	2	6	77307	77312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1524	NC_015942	TCC	2	6	77329	77334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198306
1525	NC_015942	CTC	2	6	77361	77366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198306
1526	NC_015942	GAT	2	6	77438	77443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
1527	NC_015942	CCG	2	6	77459	77464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1528	NC_015942	CAG	2	6	77547	77552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1529	NC_015942	C	6	6	77567	77572	0 %	0 %	0 %	100 %	344198306
1530	NC_015942	CCA	2	6	77708	77713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1531	NC_015942	GAG	2	6	77754	77759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198306
1532	NC_015942	TTC	2	6	77778	77783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1533	NC_015942	TCT	2	6	77849	77854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1534	NC_015942	CAT	2	6	77882	77887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198306
1535	NC_015942	AAT	2	6	77906	77911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198306
1536	NC_015942	GA	3	6	77993	77998	50 %	0 %	50 %	0 %	344198306
1537	NC_015942	ATC	2	6	78018	78023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198306
1538	NC_015942	CAC	2	6	78133	78138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1539	NC_015942	TTC	2	6	78189	78194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198306
1540	NC_015942	TCC	2	6	78223	78228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198306
1541	NC_015942	GGC	2	6	78229	78234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1542	NC_015942	GCTGC	2	10	78237	78246	0 %	20 %	40 %	40 %	344198306
1543	NC_015942	CCAG	2	8	78260	78267	25 %	0 %	25 %	50 %	344198306
1544	NC_015942	GC	4	8	78312	78319	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
1545	NC_015942	GCA	2	6	78323	78328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1546	NC_015942	GAC	2	6	78351	78356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1547	NC_015942	A	6	6	78407	78412	100 %	0 %	0 %	0 %	344198306
1548	NC_015942	GCG	2	6	78437	78442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198306
1549	NC_015942	TAA	2	6	78450	78455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198306
1550	NC_015942	ACTC	2	8	78458	78465	25 %	25 %	0 %	50 %	344198306
1551	NC_015942	CTGC	2	8	78486	78493	0 %	25 %	25 %	50 %	344198306
1552	NC_015942	GC	3	6	78536	78541	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
1553	NC_015942	A	6	6	78553	78558	100 %	0 %	0 %	0 %	344198306
1554	NC_015942	ATTA	2	8	78615	78622	50 %	50 %	0 %	0 %	344198306
1555	NC_015942	TTA	2	6	78653	78658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198307
1556	NC_015942	AAT	2	6	78668	78673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198307
1557	NC_015942	GGA	2	6	78755	78760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198307
1558	NC_015942	ATTCA	2	10	78770	78779	40 %	40 %	0 %	20 %	344198307
1559	NC_015942	AC	3	6	78923	78928	50 %	0 %	0 %	50 %	344198307
1560	NC_015942	CGC	2	6	79027	79032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198308
1561	NC_015942	TTC	2	6	79037	79042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198308
1562	NC_015942	TCTA	2	8	79054	79061	25 %	50 %	0 %	25 %	344198308
1563	NC_015942	TC	3	6	79104	79109	0 %	50 %	0 %	50 %	344198308
1564	NC_015942	GCT	2	6	79121	79126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1565	NC_015942	CAG	2	6	79308	79313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1566	NC_015942	GCA	2	6	79358	79363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1567	NC_015942	CTCA	2	8	79423	79430	25 %	25 %	0 %	50 %	344198308
1568	NC_015942	TAGA	2	8	79449	79456	50 %	25 %	25 %	0 %	344198308
1569	NC_015942	CTG	2	6	79516	79521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1570	NC_015942	CTC	2	6	79633	79638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198308
1571	NC_015942	AT	4	8	79639	79646	50 %	50 %	0 %	0 %	344198308
1572	NC_015942	GCT	2	6	79685	79690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198308
1573	NC_015942	TCA	2	6	79706	79711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198308
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1576	NC_015942	ACT	2	6	79798	79803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198308
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1580	NC_015942	TCA	2	6	80033	80038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198309
1581	NC_015942	ACAT	2	8	80092	80099	50 %	25 %	0 %	25 %	344198309
1582	NC_015942	TCA	2	6	80264	80269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
1583	NC_015942	AT	3	6	80277	80282	50 %	50 %	0 %	0 %	344198310
1584	NC_015942	T	7	7	80298	80304	0 %	100 %	0 %	0 %	344198310
1585	NC_015942	TA	3	6	80331	80336	50 %	50 %	0 %	0 %	344198310
1586	NC_015942	TCA	2	6	80357	80362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
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1589	NC_015942	CCG	2	6	80433	80438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198310
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1592	NC_015942	GCC	2	6	80604	80609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198310
1593	NC_015942	GCA	2	6	80687	80692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198310
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1596	NC_015942	CTTC	2	8	80945	80952	0 %	50 %	0 %	50 %	344198310
1597	NC_015942	TTC	2	6	81016	81021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198310
1598	NC_015942	GAA	2	6	81076	81081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198310
1599	NC_015942	CAT	2	6	81088	81093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
1600	NC_015942	AGT	2	6	81105	81110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198310
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1602	NC_015942	AATA	2	8	81308	81315	75 %	25 %	0 %	0 %	344198310
1603	NC_015942	AGA	2	6	81319	81324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198310
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1607	NC_015942	CG	3	6	81453	81458	0 %	0 %	50 %	50 %	344198310
1608	NC_015942	T	6	6	81491	81496	0 %	100 %	0 %	0 %	344198310
1609	NC_015942	ATA	2	6	81510	81515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198310
1610	NC_015942	T	6	6	81575	81580	0 %	100 %	0 %	0 %	344198310
1611	NC_015942	ATC	2	6	81641	81646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
1612	NC_015942	CAT	2	6	81696	81701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198310
1613	NC_015942	CCAT	2	8	81770	81777	25 %	25 %	0 %	50 %	344198310
1614	NC_015942	GAG	2	6	81835	81840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198310
1615	NC_015942	CTT	2	6	81912	81917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198310
1616	NC_015942	TCAT	2	8	81936	81943	25 %	50 %	0 %	25 %	344198310
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1623	NC_015942	TTTTAA	2	12	82318	82329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198311
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1625	NC_015942	GTG	2	6	82590	82595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198311
1626	NC_015942	TCCA	2	8	82603	82610	25 %	25 %	0 %	50 %	344198311
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1999	NC_015942	TGA	2	6	104436	104441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198327
2000	NC_015942	GGA	2	6	104475	104480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198327

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